Protein analysis
Proteomics & Electrophoresis
Innovative Technology Support Group for Life Science and Drug Discovery
MS3 : Total proteome identification by Nano-LC-MS/MS
시험소개
정제되지 않은 단백질체를 Protease 처리를 통해 peptide화 하고, 이것을 Automatic LC-MS/MS 분석을 통해 전체 단백질 동정 (Identification)을 목적으로 하는 시험 항목이다. 분석방법은 In-gel digestion (In-solution digestion)을 통한 단백질체 유래 peptide를 Automatic LC-MS/MS 와 Manual De-novo sequencing을 통해 전체 단백질의 동정 한다.
시험 대상
- Proteomic sample.
시험 방법
- In-Solution digestion
- Automatic LC-MS/MS
- Database search
시험결과
좌우로 스크롤하여 내용을 확인하세요.
Accession
Score
Mass
Matches
Match(sig)
Sequences
Description
BDLA_ASPNC
460
93571
28
28
12
Annexine II
AMG_ASPAW
225
68837
13
13
7
Beta-glucoamylase
AXHA_ASPNC
151
35928
5
5
2
Lipase
NLTP1_WHEAT
141
12347
8
8
4
Non-specific lipid-transfer protein (Fragment)
ABFB_ASPAW
127
53070
6
6
3
Probable alpha-L-arabinofuranosidase B
XYND_ASPAW
120
87656
6
6
3
Exo-1,4-beta-xylosidase xlnD
RN28_PANGI
116
27665
2
2
1
Ribonuclease -like storage protein
CBHA_ASPNC
102
49242
7
7
3
Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase A
PEPA_ASPAW
82
41266
5
5
4
Aspartic protease pep1
CBHC_ASPNC
70
48723
2
2
1
Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase C
시험소개
정제되지 않은 단백질체를 Protease 처리를 통해 peptide화 하고, 이것을 Automatic LC-MS/MS 분석을 통해 전체 단백질 동정 (Identification)을 목적으로 하는 시험 항목이다. 분석방법은 In-gel digestion (In-solution digestion)을 통한 단백질체 유래 peptide를 Automatic LC-MS/MS 와 Manual De-novo sequencing을 통해 전체 단백질의 동정 한다.
시험 대상
- Proteomic sample.
시험 방법
- In-Solution digestion
- Automatic LC-MS/MS
- Database search
시험결과
좌우로 스크롤하여 내용을 확인하세요.
Accession | Score | Mass | Matches | Match(sig) | Sequences | Description |
---|---|---|---|---|---|---|
BDLA_ASPNC | 460 | 93571 | 28 | 28 | 12 | Annexine II |
AMG_ASPAW | 225 | 68837 | 13 | 13 | 7 | Beta-glucoamylase |
AXHA_ASPNC | 151 | 35928 | 5 | 5 | 2 | Lipase |
NLTP1_WHEAT | 141 | 12347 | 8 | 8 | 4 | Non-specific lipid-transfer protein (Fragment) |
ABFB_ASPAW | 127 | 53070 | 6 | 6 | 3 | Probable alpha-L-arabinofuranosidase B |
XYND_ASPAW | 120 | 87656 | 6 | 6 | 3 | Exo-1,4-beta-xylosidase xlnD |
RN28_PANGI | 116 | 27665 | 2 | 2 | 1 | Ribonuclease -like storage protein |
CBHA_ASPNC | 102 | 49242 | 7 | 7 | 3 | Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase A |
PEPA_ASPAW | 82 | 41266 | 5 | 5 | 4 | Aspartic protease pep1 |
CBHC_ASPNC | 70 | 48723 | 2 | 2 | 1 | Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase C |
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