Proteomics
Electrophoresis

MS3 : Total proteome identification by Nano-LC-MS/MS

시험소개

정제되지 않은 단백질체를 Protease 처리를 통해 peptide화 하고, 이것을 Automatic LC-MS/MS 분석을 통해 전체 단백질 동정 (Identification)을 목적으로 하는 시험 항목이다. 분석방법은 In-gel digestion (In-solution digestion)을 통한 단백질체 유래 peptide를 Automatic LC-MS/MS 와 Manual De-novo sequencing을 통해 전체 단백질의 동정 한다.

시험 대상

  • Proteomic sample.

시험 방법

  • In-Solution digestion
  • Automatic LC-MS/MS
  • Database search

시험결과

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Accession Score Mass Matches Match(sig) Sequences Description
BDLA_ASPNC 460 93571 28 28 12 Annexine II
AMG_ASPAW 225 68837 13 13 7 Beta-glucoamylase  
AXHA_ASPNC 151 35928 5 5 2 Lipase
NLTP1_WHEAT 141 12347 8 8 4 Non-specific lipid-transfer protein (Fragment) 
ABFB_ASPAW 127 53070 6 6 3 Probable alpha-L-arabinofuranosidase B  
XYND_ASPAW 120 87656 6 6 3 Exo-1,4-beta-xylosidase xlnD
RN28_PANGI 116 27665 2 2 1 Ribonuclease -like storage protein  
CBHA_ASPNC 102 49242 7 7 3 Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase A  
PEPA_ASPAW 82 41266 5 5 4 Aspartic protease pep1  
CBHC_ASPNC 70 48723 2 2 1 Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase C