Proteomics
Electrophoresis

MS4 : Total proteome identification & quantitative analysis by Nano-LC-MS/MS

시험소개

정제되지 않은 단백질체를 Protease 처리를 통해 peptide로 만든다. 단백질 유래 peptide는 Automatic LC-MS/MS 분석을 통해 전체 단백질 동정 (Identification)하고 동정된 단백질의 전체 함량에 대한 시험 분석 항목이다. 분석방법은 In-gel digestion (In-solution digestion)을 통한 단백질체 유래 peptide를 Automatic LC-MS/MS 결과를 얻고, Mascot Database에서 동정된 Peptide의 비율을 조사하여 전체 단백질체 각각의 단백질 함량을 분석한다.

시험 대상

  • Proteomic sample
  • Protein Sample

시험 방법

  • In-Solution digestion
  • Automatic LC-MS/MS
  • Database search
  • Protein composition

시험결과

좌우로 스크롤하여 내용을 확인하세요.
Accession Score Mass Matches Match(sig) Sequences Seq(sig) emPAI Description Protein content (weight %)
BDLA_ASPNC 460 93571 28 28 12 12 0.42 Annexine II 32.54
AMG_ASPAW 225 68837 13 13 7 7 0.32 Beta-glucoamylase   18.24
AXHA_ASPNC 151 35928 5 5 2 2 0.16 Lipase 4.76
NLTP1_WHEAT 141 12347 8 8 4 4 1.3 Non-specific lipid-transfer protein (Fragment)  13.29
ABFB_ASPAW 127 53070 6 6 3 3 0.16 Probable alpha-L-arabinofuranosidase B   7.03
XYND_ASPAW 120 87656 6 6 3 3 0.1 Exo-1,4-beta-xylosidase xlnD   7.26
RN28_PANGI 116 27665 2 2 1 1 0.1 Ribonuclease-like storage protein   2.29
CBHA_ASPNC 102 49242 7 7 3 3 0.18 Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase A   7.34
CBHC_ASPNC 70 48723 2 2 1 1 0.06 Probable 1,4-beta-D-glucan cellobiohydrolase C   2.42
ABNC_ASPNC 65 34311 3 3 2 2 0.17 Probable arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase C   4.83